Najnowsze badanie przeprowadzone przez Zakład Diagnostyki Laboratoryjnej Drugiego Szpitala Klinicznego Uniwersytetu Nanchang oraz BGI Genomics, opublikowane na początku maja w czasopiśmie Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, wskazuje, że metagenomiczne sekwencjonowanie nowej generacji (mNGS) umożliwia wczesne wykrywanie patogenów układu oddechowego. Pozwala to na szybsze wdrożenie ukierunkowanego leczenia przeciwinfekcyjnego, co znacząco poprawia rokowania pacjentów.
Przewaga mNGS nad klasycznymi metodami
Konwencjonalne testy mikrobiologiczne (CMT) polegają na hodowli, mikroskopii oraz ukierunkowanych testach PCR, oferując wysoką swoistość, ale ograniczony zakres wykrywania. Choć są nadal efektywne kosztowo w przypadku typowych infekcji, mNGS oferuje znacznie szersze spektrum detekcji i szybszy czas uzyskania wyników, umożliwiając identyfikację rzadkich i atypowych patogenów (np. Pneumocystis, herpeswirusy) w ciągu kilku dni — kluczowych dla szybkiego i precyzyjnego leczenia.
Badanie wykazało, że mNGS wykrył patogeny w 86% przypadków, podczas gdy testy CMT tylko w 67%. mNGS zidentyfikował 59 bakterii, 18 grzybów, 14 wirusów oraz 4 rzadkie patogeny, podczas gdy tradycyjne metody wykryły zaledwie 28 jednostek chorobotwórczych. Tak szerokie spektrum wykrywania zapewnia klinicystom bardziej kompleksowe narzędzie diagnostyczne w przypadku zakażeń płuc.
Precyzyjna medycyna dzięki mNGS
Badanie potwierdziło również, że mNGS jest skuteczne w prowadzeniu terapii u pacjentów z trudno rozpoznawalnymi zakażeniami. U 16 pacjentów zakażonych patogenami, które zwykle umykają tradycyjnym metodom, modyfikacja leczenia oparta na wynikach mNGS poprawiła rokowania.
Dzięki mNGS lekarze zmodyfikowali antybiotykoterapię u 133 pacjentów, z czego 40,6% przypadków skorzystało na bardziej ukierunkowanym leczeniu. Choć w jednym przypadku zastosowano niepotrzebnie antybiotyk, ogólne wyniki potwierdzają przydatność mNGS w optymalizacji opieki medycznej.
Wykrywanie patogenów atypowych
mNGS doskonale sprawdza się w wykrywaniu patogenów trudnych do zdiagnozowania klasycznymi metodami, takich jak: Mycobacterium tuberculosis, Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia psittaci, a także grzyby jak Pneumocystis jirovecii i Talaromyces marneffei. Wszystkie te jednostki zostały z powodzeniem zidentyfikowane dzięki nowoczesnej metodzie.
„Metagenomiczne sekwencjonowanie nowej generacji (mNGS) zapewnia szerokospektralne, szybkie i precyzyjne podejście diagnostyczne w wykrywaniu patogenów infekcji płucnych. Umożliwia to wdrożenie spersonalizowanego leczenia przeciwinfekcyjnego i poprawia wyniki terapii” – komentuje prof. Wang Xiaozhong, dyrektor Zakładu Diagnostyki Laboratoryjnej Drugiego Szpitala Klinicznego Uniwersytetu Nanchang i autor korespondujący badania.
Profesor Wang zauważa również, że przyszłością diagnostyki infekcji płucnych jest połączenie mNGS z objawami klinicznymi, wynikami obrazowania i tradycyjnymi metodami testowania w celu stworzenia zintegrowanego modelu diagnostyczno-terapeutycznego: „szybka identyfikacja — precyzyjna interwencja — dynamiczne monitorowanie”. Taki model ma zapewnić pacjentom bardziej naukowe, efektywne i spersonalizowane strategie leczenia.
Źródło: Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, BGI Genomics
